DynaDock 免费 分子处理工具箱:复合物拆分、格式转换与口袋预测

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复合物拆分(化合物拆分) 结合口袋预测 小分子格式转换 蛋白质格式转换 PDB 预处理
选择工具
拆分复合物
从 PDB 中分离蛋白和配体
蛋白质格式转换
PDB/PDBQT/MOL2 互转
小分子格式转换
SDF/MOL2/PDB/SMILES 互转
对接前准备
清理 PDB 注释/水/离子
口袋预测 & 可视化
fpocket 预测 + 3D 展示

结合口袋预测 & 可视化

使用 fpocket 预测蛋白质表面结合口袋,输出每个口袋的坐标、范围,并在蛋白质 3D 结构上可视化

点击或拖拽上传蛋白质 PDB 文件

上传蛋白质 PDB 文件并点击"预测口袋"结果将在此处以 3D 形式展示口袋位置

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