专业的一站式
分子对接 · 分子动力学模拟平台

我们是专业的分子对接 · 分子动力学模拟一站式平台

整合专业对接引擎、动力学引擎、三维可视化与结合自由能分析，提供从蛋白质-配体对接、动力学模拟到科研报告交付的全流程自动化服务。

• 高精度分子对接，自动口袋识别
• 全自动 MD 模拟，科研级精度
• 完整分析报告，论文级图表
• 断点续跑，稳定高效
• 免费提供各类分子处理小工具

一站式对接任务管理

提交对接任务、设置对接参数、查看任务状态，所有操作在一个界面完成。支持盲对接、活性口袋识别、多盒子并行。

• 任务实时状态追踪
• 自动配体准备与口袋识别
• 多构象排序与筛选

多维对接结果展示与相互作用可视化

对接完成后自动生成多维度结果展示：Vina 打分排序、构象列表、3D 结构可视化与 2D 相互作用图，并可一键发起 MD 模拟。

• 对接构象列表 + Vina 打分排序
• 3D 构象可视化（卡通/表面/球棍多模式）
• PandaMap 2D 相互作用图
• BINANA 相互作用分析（氢键/疏水/π-π堆积/盐桥/卤键/金属配位）
• BINANA Web 交互式分析

全自动 MD 模拟与全套分析

从对接结果一键发起 GROMACS MD 模拟，自动完成体系构建、能量最小化、NVT/NPT 平衡、生产模拟与全套后分析，科研级精度。共自动生成 20+ 张专业分析图表。

• RMSD 蛋白/配体/复合物 + RMSF 残基波动
• 回转半径 Rg + SASA 溶剂可及表面积
• 蛋白-配体氢键 + 配体 RMSD
• 温度 / 压力 / 密度 / 动能 / 势能 / 总能量监控
• MMPBSA 结合自由能 + 残基自由能分解
• PCA 特征值谱 + PC1/PC2 自由能景观(2D/3D)
• RMSD/Rg 自由能景观(2D/3D) + 构象聚类
• 残基接触频率 + 接触热图 + 距离-角度演变 + 相关性矩阵

分子处理免费小工具

面向科研用户免费开放，覆盖分子预处理的常用需求，即用即走，无需提交任务。

• 拆分复合物：蛋白质-配体分离、去水去离子
• 蛋白格式转换：PDB / PDBQT / MOL2 互转
• 配体格式转换：SDF / MOL2 / PDBQT 互转
• 对接前准备：蛋白预处理、配体加氢加电荷
• 结合口袋预测：fpocket 自动识别口袋

服务价格一览

• 分子对接 + 分析 — 10 元起
• 分子动力学模拟 + 分析 — 250 元起
• 小工具 — 免费使用
• 报告存档 — 3 个月（交付之日起算）